MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 41104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015562	TGG	2	6	47999	48004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333909934
1002	NC_015562	TCA	2	6	48005	48010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909934
1003	NC_015562	TTTC	2	8	48013	48020	0 %	75 %	0 %	25 %	333909934
1004	NC_015562	TTCT	2	8	48054	48061	0 %	75 %	0 %	25 %	333909934
1005	NC_015562	ACA	2	6	48097	48102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909934
1006	NC_015562	AAT	2	6	48129	48134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909934
1007	NC_015562	C	6	6	48145	48150	0 %	0 %	0 %	100 %	333909934
1008	NC_015562	TTG	2	6	48169	48174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909934
1009	NC_015562	TAA	2	6	48192	48197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909934
1010	NC_015562	AAATT	2	10	48200	48209	60 %	40 %	0 %	0 %	333909934
1011	NC_015562	TTC	2	6	48210	48215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909934
1012	NC_015562	ATT	2	6	48240	48245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909934
1013	NC_015562	A	6	6	48246	48251	100 %	0 %	0 %	0 %	333909934
1014	NC_015562	TCA	2	6	48298	48303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909934
1015	NC_015562	TCC	2	6	48311	48316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909934
1016	NC_015562	T	6	6	48331	48336	0 %	100 %	0 %	0 %	333909934
1017	NC_015562	TTACTG	2	12	48365	48376	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333909934
1018	NC_015562	GCAA	2	8	48394	48401	50 %	0 %	25 %	25 %	333909934
1019	NC_015562	TTA	2	6	48407	48412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909934
1020	NC_015562	GTTTT	2	10	48417	48426	0 %	80 %	20 %	0 %	333909934
1021	NC_015562	ATGC	2	8	48435	48442	25 %	25 %	25 %	25 %	333909934
1022	NC_015562	GTTAAA	2	12	48454	48465	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333909934
1023	NC_015562	GCA	2	6	48490	48495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909934
1024	NC_015562	AAAT	2	8	48557	48564	75 %	25 %	0 %	0 %	333909934
1025	NC_015562	GCAA	2	8	48573	48580	50 %	0 %	25 %	25 %	333909934
1026	NC_015562	TTTG	2	8	48622	48629	0 %	75 %	25 %	0 %	333909934
1027	NC_015562	T	6	6	48638	48643	0 %	100 %	0 %	0 %	333909934
1028	NC_015562	CTT	2	6	48650	48655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909934
1029	NC_015562	TTC	2	6	48671	48676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909934
1030	NC_015562	ACA	2	6	48703	48708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909934
1031	NC_015562	CTTTTT	2	12	48762	48773	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	333909934
1032	NC_015562	TCA	2	6	48805	48810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909934
1033	NC_015562	AATT	2	8	48818	48825	50 %	50 %	0 %	0 %	333909934
1034	NC_015562	TCTTA	2	10	48915	48924	20 %	60 %	0 %	20 %	333909934
1035	NC_015562	T	7	7	48959	48965	0 %	100 %	0 %	0 %	333909934
1036	NC_015562	TAA	2	6	49019	49024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909934
1037	NC_015562	A	6	6	49023	49028	100 %	0 %	0 %	0 %	333909934
1038	NC_015562	ATA	2	6	49039	49044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909934
1039	NC_015562	AT	3	6	49112	49117	50 %	50 %	0 %	0 %	333909934
1040	NC_015562	TAA	2	6	49131	49136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909934
1041	NC_015562	T	6	6	49155	49160	0 %	100 %	0 %	0 %	333909934
1042	NC_015562	T	6	6	49199	49204	0 %	100 %	0 %	0 %	333909934
1043	NC_015562	TCA	3	9	49232	49240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909934
1044	NC_015562	TTAT	2	8	49578	49585	25 %	75 %	0 %	0 %	333909935
1045	NC_015562	CAA	2	6	49622	49627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909935
1046	NC_015562	ATTT	2	8	49683	49690	25 %	75 %	0 %	0 %	333909935
1047	NC_015562	T	7	7	49688	49694	0 %	100 %	0 %	0 %	333909935
1048	NC_015562	TCT	2	6	49699	49704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909935
1049	NC_015562	TTA	2	6	49750	49755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909935
1050	NC_015562	ATC	2	6	49806	49811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909935
1051	NC_015562	AAC	2	6	49827	49832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909935
1052	NC_015562	GCAA	2	8	50058	50065	50 %	0 %	25 %	25 %	333909935
1053	NC_015562	ACA	2	6	50152	50157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909935
1054	NC_015562	T	6	6	50172	50177	0 %	100 %	0 %	0 %	333909935
1055	NC_015562	CAA	2	6	50240	50245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909935
1056	NC_015562	CAA	2	6	50745	50750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909936
1057	NC_015562	T	6	6	50828	50833	0 %	100 %	0 %	0 %	333909936
1058	NC_015562	TCA	2	6	50840	50845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909936
1059	NC_015562	TCC	2	6	50852	50857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909936
1060	NC_015562	TAG	2	6	50881	50886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909936
1061	NC_015562	TCC	2	6	50887	50892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909936
1062	NC_015562	AAT	2	6	50918	50923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909936
1063	NC_015562	T	7	7	50955	50961	0 %	100 %	0 %	0 %	333909936
1064	NC_015562	TTG	2	6	50964	50969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909936
1065	NC_015562	TTTA	2	8	50974	50981	25 %	75 %	0 %	0 %	333909936
1066	NC_015562	CTG	2	6	50996	51001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333909936
1067	NC_015562	CTT	2	6	51082	51087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909936
1068	NC_015562	TGT	2	6	51127	51132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909936
1069	NC_015562	ATG	2	6	51155	51160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909936
1070	NC_015562	TTC	3	9	51163	51171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909936
1071	NC_015562	CTC	2	6	51172	51177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909936
1072	NC_015562	TC	3	6	51308	51313	0 %	50 %	0 %	50 %	333909936
1073	NC_015562	CCT	2	6	51332	51337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909936
1074	NC_015562	ATT	2	6	51356	51361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909936
1075	NC_015562	ATT	2	6	51374	51379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909936
1076	NC_015562	GCA	2	6	51431	51436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909936
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1082	NC_015562	TCA	2	6	51629	51634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909936
1083	NC_015562	T	6	6	51769	51774	0 %	100 %	0 %	0 %	333909936
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1085	NC_015562	GCA	2	6	52726	52731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909937
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1095	NC_015562	TG	3	6	52973	52978	0 %	50 %	50 %	0 %	333909937
1096	NC_015562	TGA	2	6	53028	53033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909937
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1100	NC_015562	AT	3	6	53179	53184	50 %	50 %	0 %	0 %	333909937
1101	NC_015562	ATA	2	6	53191	53196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909937
1102	NC_015562	AAG	2	6	53203	53208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909937
1103	NC_015562	ATT	2	6	53210	53215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909937
1104	NC_015562	CTATG	2	10	53268	53277	20 %	40 %	20 %	20 %	333909937
1105	NC_015562	TAAA	2	8	53318	53325	75 %	25 %	0 %	0 %	333909937
1106	NC_015562	A	6	6	53323	53328	100 %	0 %	0 %	0 %	333909937
1107	NC_015562	GCA	2	6	53410	53415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909937
1108	NC_015562	GA	3	6	53469	53474	50 %	0 %	50 %	0 %	333909937
1109	NC_015562	AAG	2	6	53494	53499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909937
1110	NC_015562	AAG	2	6	53581	53586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909937
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1113	NC_015562	ATT	2	6	54076	54081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909938
1114	NC_015562	AAG	2	6	54125	54130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909938
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1119	NC_015562	ATA	2	6	54273	54278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909938
1120	NC_015562	TAA	2	6	54346	54351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909938
1121	NC_015562	ATGAAG	2	12	54352	54363	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333909938
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